凈化工作臺的清潔和保養主要為以下幾個方面：
1、使用工作臺時，先經過清潔液浸泡的紗布擦拭臺面，然后用消毒劑擦拭消毒。
2、接通電源，提前50分鐘打開紫外燈照射消毒，處理凈化工作區內工作臺表面積累的微生物，30分鐘后，封閉紫外燈，開啟送風機。
3、工作臺面上，不要存放不必要的物品，以保持工作區內的潔凈氣流不受干擾。
4、操縱結束后，清理工作臺面，收集各廢棄物，封閉風機及照明開關，用清潔劑及消毒劑擦拭消毒。
5、后開啟工作臺紫外燈，照射消毒30分鐘后，封閉紫外燈，切斷電源。
6、應安放于衛生條件較好的地方，便于清潔，門窗能夠密封以避免外界的污染空氣對室內的影響。
7、安放位置應闊別有震動及噪音大的地方。
8、嚴禁安放在產生大塵粒及氣流大的地方，以保證操縱區空氣的正常活動。